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Parameterschätzung in einem Perkolationsmodell mit Färbung

Seminar im ZBSA Freiburg mit Felix Beck (AG Mélykúti) am Dienstag, 13. Oktober 2015 15:00 – 16:00 Uhr; Raum: -01.026 UG

In dem Vortrag erstellen wir eine statistische Methode zur Schätzung der Kontaminationsrate und der wahren DNA-Konzentration in einer digitalen Polymerase-Kettenreaktion. Wir geben eine kurze Einführung in Perkolationstheorie und erklären die Algorithmen für die method of moments, die generalized method of moments und die method of simulated moments (MSM), welche statistische Methoden zur Parameterschätzung sind. Des Weiteren definieren wir ein mathematisches Modell, um die MSM an unsere Bedürfnisse anzupassen. Wir benutzen MATLAB für die Implementierung des Modells und um unsere MSM Schätzer zu erhalten. Abschließend testen wir unser Programm an synthetischen und echten Laborexperimenten und bewerten unsere MSM Schätzer.

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Center for Biological Systems Analysis

University of Freiburg

 

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    Habsburgerstr. 49
    79104 Freiburg
    Germany
 
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    Hauptstr. 1
    79104 Freiburg
 

 

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